Мы используем файлы cookie для того, чтобы сделать наш сайт максимально удобным для вас
Ок, скройся

Часть 5. Проведение и документирование исследований

Шурик:
Так, эксперимент спланировали, готов приступать к работе!
АД:
Конечно, но сначала давайте заведём лабораторный журнал

5.1. Зачем нужен лабораторный журнал

Лабораторный журнал - это полная запись всех экспериментальных процедур, реагентов, данных и даже мыслей. Опционально в него может быть включено объяснение того, почему были начаты эксперименты, а также их результаты. При этом очень важно указывать вообще данные, даже «неудачные» или «противоречивые».
Запись обычно содержит следующие пункты:
  • дата
  • название проекта/название эксперимента, их цели
  • протокол, вычисления, реагенты, оборудование
  • наблюдения
  • результаты и их предварительный анализ
  • выводы и идеи для дальнейшей работы

Лабораторный журнал является собственностью лаборатории и хранится всегда в ней, то есть забрать его домой нельзя. В любой момент другой сотрудник может взять ваш журнал и проследить, что и как вы делали. Более того, если вы уходите из лаборатории насовсем, журнал остаётся в ней, чтобы следующие поколения несчастных сотрудников смогли при необходимости повторить ваши эксперименты.
Лабораторный журнал является юридическим документом для подтверждения патентов и защиты ваших данных в случае их утечки или обвинений в мошенничестве. Именно поэтому нельзя вырывать или пропускать страницы, а также использовать корректор. Ошибку лучше зачеркнуть и поставить свою подпись. Иногда тетрадь для лабораторного журнала выдаётся организацией; она имеет официальный стиль и кодовую нумерацию страниц, а наличие журнала на месте и качество его ведения могут контролироваться проверками. Это важно для организации в случае патентных споров, юридические аспекты которых она обычно берёт на себя.
Вести лабораторный журнал важно и для себя. Например, я всегда записываю в него все расчёты по разведению веществ, и если эксперимент пошёл не по плану — всегда можно себя перепроверить. А ещё — не пересчитывать каждый раз заново. Для химиков может оказаться важным указание окружающей температуры и влажности: у нас были прецеденты изменения поведения полимера из-за летней жары, вследствие чего накрылись все последующие эксперименты. В журнале также можно указать места, где хранятся те или иные реактивы, контакты коллег, у которых ты их взял, и в целом всё, что может понадобиться в будущем.
Шурик:
То есть я должен ходит и всё записывать в тетрадку? И это в 21 веке?
АД:
Весли лабораторный журнал можно и в электронном виде. Я расскажу про преимущества и недостатки разных способов

5.2. Как вести лабораторный журнал

Классически лабораторный журнал - это тетрадка формата А4 или А5, в которую ручкой вносятся все данные. Не рекомендуется использовать тетради на пружинах, так как страницы могут отрываться, а также тетради со сменными блоками, поскольку они не будут иметь юридическую силу в случае судебных разбирательств. Ведь в них можно добавлять и убирать страницы как душе угодно
Плюсы бумажных журналов
  • Автономность и надежность
    Не требует подключения к интернету, зарядки, не зависит от сбоев ПО.
  • Юридическая сила
    Оригинал записи с подписью, зафиксированный на бумаге, часто признается надежным доказательством при защите интеллектуальной собственности.
  • Простота использования
    Не требует обучения или сложной настройки, доступен сразу в любой момент.
Минусы бумажных журналов
  • Риск потери данных
    Бумагу легко испортить реактивами, случайно сжечь или потерять. Восстановить данные невозможно.
  • Сложность поиска и структурирования
    Нет функции поиска по ключевым словам, сложно найти запись по названию образца спустя время. Лично я для этого использовала ключевые слова и цветные выделители
  • Ограничение по объёму информации
    В бумажный лабораторный журнал неудобно переписывать большие протоколы, экспортировать настройки приборов или связывать эксперимент с датасетом его результатов
В качестве альтернативы могут использоваться электронные лабораторные журналы. Вот несколько сервисов с бесплатными версиями, позволяющих вести знания:

  • LabArchives - интегрируется с MS Office и GraphPad Prism, а также базами PubMed, PubChem, SnapGene. В целом имеет достаточно простой и понятный интерфейс. Доступ осуществляется через браузер с любых устройств.
  • LabFolder - организована командная работа через комментарии и сообщения. Есть интеграция с MS Office. Можно использовать как сервер для хранения данных любых форматов. И также есть встроенный модуль для систематизации оборудования и реактивов.
  • Sapio ELN - фишкой этого журнала является встроенный ИИ-помощник, а также мощный модуль для анализа и визуализации данных. Плюс также есть инструменты для молбиола типа дизайна праймеров, плазмид и тд.
  • OdanLab - свежий продукт от российских разработчиков. Можно сделать склад реактивов и следить за их расходованием, организовывать совместную работу в проектах, а также есть полезные фишки для химиков.
Также некоторые исследователи используют платформы типа Notion, Yonote или Obsidian для ведения своих записей.

Плюсы электронных журналов
  • Простота навигации
    Электронный лабжурнал легче организовать и по нему легче осуществлять поиск. Как минимум через ctrl+F, как максимум через систему хештего
  • Возможна коллективная работа
    Удобно, что можно объединять разные работы в рамках одного проекта. Как руководителю мне иногда тяжело бегать между журналами студентов в поисках нужной информации
  • Много форматов
    Можно вставлять изображения, графики, аудио и всё что угодно, что позволяет собирать более полную информацию об эксперименте
Минусы электронных журналов
  • Доступность
    Нужен интернет и удобное приложение/устройство. Иногда в перчатках сложно набрать текст на телефоне, а вот взять ручку и написать гораздо проще
  • Безопасность данных
    Возможность кибератак и утечки данных
  • Стоимость
    Многие действительно удобные решения - платные
Шурик:
Денег у меня конечно же нет, так что возьму для лабжурнала тетрадку, оставшуюся ещё со школы
АД:
Давайте расскажу, что в этой тетрадке стоит писать

5.3. Как правильно фиксировать данные в журнале

Единого стандарта ведения лабораторного журнала не существует, каждый исследователь заполняет его по-своему (а кто-то и вовсе не заполняет). Но мой опыт показывает, что уже через полгода ты забываешь всё, что делал, и если нужно восстановить процесс для статьи или повторить эксперимент, начинаются проблемы. Так что я выделила следующие пункты для заполнения:

5.4. Как организовать хранение результатов

Помимо структурирования научной литературы или записей в лабжурнале важно структурировать также и файлы с результатами экспериментов. Иначе полученные данные рискуют просто затеряться в хаосе. Так что вот несколько советов по тому как структурировать свои файлики, чтобы потом не сойти с ума в поисках нужного.
  • 1 папка — 1 проект. Выше я уже упоминала, что к каждому эксперименту нужно подписывать проект, в рамках которого он делается, особенно если вы молодец и участвуете сразу в нескольких. Аналогично и с папками, например, у меня они называются либо по руководителю гранта (РНФ Иванов), либо по основной тематике (Notch project). Кстати, в почте я тоже организовала тематические папки по проектам, и теперь удобно искать письма.

  • Внутри основной папки создайте тематические подпапки. Я предпочитаю разделять по методикам, например, папки имеют названия: цитометрия, ИГХ, КТ и т.д. + обязательно папка manuscript, внутри которой отдельно собирается вся информация для статьи: отдельно картинки, отдельно данные и таблицы. Кстати, после ревизии внутри manuscript появляется ещё одна папка revision (или больше одной). Также могут быть папки со статьями (хотя их можно создать в Mendeley или Zotero отдельно под каждый проект), папка с выступлениями и презентациями, папка со скриптами и т.д.
  • Внутри тематических папок находятся уже отдельные эксперименты. Например, в случае фотографий с гистологического окрашивания, в названии папки можно писать краситель и дату эксперимента. Удобно потом сверяться с лабжурналом. Иногда с эксперимента получаешь только одну жалкую табличку, и тогда нужно сохранить её с названием и датой эксперимента. Кстати, название должно быть понятным и отражать содержание, а не просто быть набором букв.
  • В целом, обязательно записывайте даты и версии файлов. Да, в свойствах можно посмотреть, но они иногда сбиваются, например, если скачиваешь файл из облака на новый компьютер. И чтобы не запутаться, я рекомендую писать дату последнего редактирования файла в названии. Например, manuscript_21.10.2015.
  • В сети также рекомендуют создавать файл README с основной информацией по проекту, навигацией по папкам, комментариями и т.д. Идея выглядит хорошей, но, если честно, я никогда так не делала, а теперь, видимо, начну. А то спустя год отдельные эксперименты уже не понимаю
  • Храните данные в облаке. После того, как я потеряла часть диплома из-за поломки жесткого диска, все мои файлы лежат в облаке и постоянно туда подгружаются. Это можно делать через OneDrive, Google Drive, Dropbox, Яндекс.Диск, Облако Mail.ru и так далее. У всех них есть приложение, которое создает отдельную папку на компе, которая постоянно синхронизируется. Часть файлов можно хранить только в облаке, чтобы не занимать память компьютера. И, например, я поработала с файлами в такой папке на работе, потом пришла домой, открыла комп — и все новые версии сразу погрузились. Из программ лично мне нравится Google Диск, но Google не хочет принимать мои кровавые рубли за дополнительный объём. Так что пользуюсь Яндекс.Диском — чуть хуже, но зато недорого.
  • Делайте бэкапы. Хранение в облаке, конечно, замечательно, но на всякий случай стоит иметь свои данные и на физическом носителе. Можно архивировать проекты и хранить на жёстком диске.
  • Регулярно проверяйте папки: удаляйте лишнее, проверяйте, все ли данные на месте, обновляйте README и т.д.